Helen Hendriks studeerde aan het conservatorium van Maastricht bij Michel Lefebvre. 
Vanaf 1986 was zij werkzaam als dwarsfluitdocent aan de muziekscholen van Thorn, Lanaken en Sittard. Daarnaast was zij actief als kamermusicus, remplaçant bij diverse orkesten en studiomuzikant.
Vanaf augustus 2005 is Helen afdelingshoofd bij Artamuse, het Centrum voor Muziek en Dans, in Sittard-Geleen. Na een periode van ruim 20 jaar intensief doceren legt zij zich weer meer toe op het zelf musiceren. Sinds 2005 zij is verbonden aan blazersensemble Zuiderwind.